竹石生物发布国内首款基于单分子识别的临床级肝癌早检产品

 

重磅!竹石生物发布国内首款基于单分子识别的

      临床级肝癌早检产品  ——甘晓宁™ 

 

我国是肝癌大国,肝癌的5年总生存率目前仅为14.1%,70-80%的患者在诊断时已经是中晚期,错过了最佳的治疗时机,如果能够早发现,早治疗,可以大幅提升5年生存率。
 

现有的诊疗策略和措施对降低肝癌的5年总病死率非常有限,新的肝癌筛查、诊疗策略极其迫切。

聚焦 权威共识

1、据《原发性肝癌的分层筛查与监测指南(2020)》,0期或A期肝癌患者5年总生存率可高达69.0%-86.2%。对肝癌风险患者进行风险分层并采用不同的监测手段有助于更早发现癌症。

2、据《中国肝癌早筛策略专家共识(2021)》,以cfDNA甲基化信息为主要标志物的液体活检展现出较好的早筛性能。

相较于其他癌种(如肠癌),肝癌受个体异质性、肿瘤内异质性、多发异质性、微环境异质性等多因素共同作用,是目前异质性最强的癌症之一,很难通过少数位点实现精准识别。肝癌精准早筛早诊也已成为业界公认的高难度研发项目。
 

竹石生物团队瞄准痛点,精准发力,成功攻克难关,现正式发布其首款肝癌早检(液体活检)产品——甘晓宁

 

 

 甘晓宁™


 

竹石生物联合江苏省人民医院、上海交通大学医学院附属新华医院、苏州大学附属第一医院、苏州市第五人民医院开展多中心临床研究,基于1000+真实临床样本,发布肝癌(HCC)早检产品甘晓宁

 

甘晓宁™采用竹石生物自主NEEM-seq湿实验技术和DeepTrace多组学预训练神经网络,具有94.4%灵敏度和98.0%特异性。

 

 

甘晓宁™适用人群:

 

 

 

 产品优势


1、临床级早检产品

 

甘晓宁™聚焦临床高危/极高危人群需求,提供专业临床级早检服务。

 

 

2、更早地发现早期肝癌

 

3、首款基于单分子识别的癌症早检产品

与过去的早筛早检产品基于位点组合、整体模式的算法模型不同,甘晓宁™对每个cfDNA分子进行逐一识别,所得出的风险值与进入血液的ctDNA比例高度相关,可以作为患者诊疗不同阶段的定期监测指标。

 

技术创新


为了突破现有技术平台的局限性,竹石生物积极拥抱创新,掌握多项革命性新技术,形成以NEEM-seq湿实验技术和DeepTrace预训练神经网络为核心的自主技术平台。
 

1、酶学转化多组学建库技术NEEM-seq

 

DNA表观修饰与癌症发生和进展有密切关联,cfDNA甲基化状态是癌症液体活检中最重要的指标之一。

 

但是,传统的DNA甲基化实验依赖于Bisulfite这一剧烈的化学反应,会造成DNA链的不均匀损伤、断裂,从而破坏原样本的片段分布、核小体印记信息。

 

竹石生物基于最新的酶学转化法自主研发出NEEM-seq湿实验技术,不仅能完整保留原始DNA长度信息,一次建库,获取多组学数据,还能提供比Bisulfite转化更准确的甲基化状态信息。

 

 

2、首个全基因组多组学预训练神经网络

 

过去,液体活检的分析算法多采用统计模型和简单机器学习模型。为了充分利用NEEM-seq全基因组多组学数据,竹石生物建立多学科人才储备,搭建了DeepTrace大型预训练神经网络。

 

预训练神经网络作为NLP领域的新宠,已在百度、阿里、字节等AI先驱公司中得到普遍运用。谷歌公司最新发布用于蛋白质结构预测的AlphaFold也同样基于深度神经网络。

 

得益于突破性的神经网络架构,甘晓宁™能在浅层全基因组测序数据的基础上,以单分子分辨率准确识别血液中的ctDNA分子。

 

 
 

未来展望


在产品布局上,竹石生物将甘晓宁™作为肝癌精筛型产品,并通过神经网络可视化进行marker筛选和精简,进行基于PCR平台的普筛型IVD产品开发,让更多肝癌危险人群从早筛中获益。

 
另外,竹石生物正在将研发延展应用到慢乙肝隐性活跃标记物、肝硬化标记物、肝癌预后评估、肝癌复发监测,构建“肝炎-肝硬化-肝癌”的全病程早检解决方案,助力临床和患者实施更精准的诊断、治疗。
 
 

 

关于竹石生物 

 

竹石生物科技(苏州)有限公司是一家由生物计算驱动,专注疾病诊断与治疗的生物科技企业。当前正致力将领先组学技术与先进AI技术相结合,聚焦于肿瘤早期检测技术的研发和临床应用。

 
 

 

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