ATAC-seq锚点

ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing) 是2013年由斯坦福大学William J. GreenleafHoward Y. Chang实验室开发的用于研究染色质可及性的方法。

 

其原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质的特性,使用携带已知序列DNA标签的转座酶复合物对开放染色质上DNA进行捕获。


真核生物的核DNA并不是裸露的,而是与组蛋白结合形成染色体的基本结构单位核小体,核小体再经逐步的压缩折叠最终形成染色体高级结构。DNA的复制转录过程需要将DNA的紧密结构打开,这部分打开的染色质,就叫开放染色质,打开的染色质允许其他调控因子结合的特性称为染色质的可及性(chromatin accessibility)。

 

ATAC-Seq由于步骤更少,结果稳定可靠,并可以在全基因组范围内检测染色质的开放状态,目前已经成为研究染色质开放性的首选技术方法。



 

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